中心管理實行責任製，根據實驗課程的設置情況下設若幹實驗室與辦公室，各實驗室管理人員（包括助管研究生）負責該實驗室儀器與設備的日常維護、所承擔實驗課的準備以及開放實驗室等工作，辦公室負責中心的日常運作與管理，實驗教學教師與實驗室管理人員均按學校相關崗位職責進行考核。為保證實驗教學中心科學有效規範的運行，中心製定了一係列管理規章製度，包括：

《自動化學院實驗工作人員崗位職責》；

《自動化學院實驗儀器管理製度》；

《自動化學院實驗中心安全製度》；

《自動化學院儀器設備損壞、丟失賠償製度》；

《自動化學院資料、儀器管理員崗位職責》；

《信息與控製工程實驗中心主任崗位職責》；

《信控實驗室安全責任人崗位職責》；

《信控係實驗中心實驗員崗位責任補充規定》；

《信控係及信控實驗中心緊急突發事件的應急預案》；

《信控係實驗中心畢業設計開放辦法》；

《信息與控製實驗中心實驗隊伍建設規劃》；

《關於在實驗中加強對學生動手能力培養的措施》；

《實驗室開放管理辦法》；

《實驗儀器設備借用製度》；

《畢設教室安全防範細則》。